Struktur dan Materi Genetik Virus HIV

Struktur dan Materi Genetik Virus HIV - HIV memiliki diameter 100-150 nm dan berbentuk sferis (spherical) hingga oval karena bentuk selubung yang menyelimuti partikel virus (virion). Selubung virus berasal dari membran sel inang yang sebagian besar tersusun dari lipida. Di dalam selubung terdapat bagian yang disebut protein matriks.
Bagian internal dari HIV terdiri dari dua komponen utama, yaitu genom dan kapsid. Genom adalah materi genetik pada bagian inti virus yang berupa dua kopi utas tunggal RNA. Sedangkan, kapsid adalah protein yang membungkus dan melindungi genom.
Berbeda dengan sebagian besar retrovirus yang hanya memiliki tiga gen (gag, pol, dan env), HIV memiliki enam gen tambahan (vif, vpu, vpr, tat, ref, dan nef). Gen-gen tersebut disandikan oleh RNA virus yang berukuran 9 kb. Kesembilan gen tersebut dikelompokkan menjadi tiga kategori berdasarkan fungsinya, yaitu gen penyandi protein struktural (Gag, Pol, Env), protein regulator (Tat, Rev), dan gen aksesoris (Vpu hanya pada HIV-1, Vpx hanya pada HIV-2; Vpr, Vif, Nef).

Nama Gen dan Protein yang disandikan :

1. Tat (trans-aktivator transkripsi)
2. Rev (regulator ekspresi protein virus)
3. Vif (faktor infektivitas virus)
4. Vpr (Protein R virus)
5. Vpx (Protein X virus)
6. Vpu (Protein U virus)
7. Nef (Faktor Negatif)

Ukuran:

1. 86 asam amino (AA), 2 ekson, 14 kDalton
2. 116 AA, 2 ekson, 19 kDalton
3. 192 AA, 23 kDalton
4. 96-106 AA, 10-15 kDalton
5. 112 AA, 12-16 kDalton
6. 81 AA (terfosforilasi), 9,2 & 16 kDalton
7. 206 AA, 27 kDalton

Lokalisasi :

1. nukleus, nukleolus, protein awal
2. nukleus, di antara sitoplasma dan nukleolus
3. sitoplasma, beberapa molekul yang terbungkus dalam virion dewasa
4. komponen dari inti virus dan kompleks membran
5. komponen virion
6. retikulum endoplasma, protein transmembran
7. virion, sitoplasma, nukleus

Fungsi :

1. Penting untuk replikasi; Trans-aktivasi ekspresi mRNA virus, mengatur ekspresi sitokin dan reseptor. 
2. Penting untuk replikasi; mengatur transkripsi dan ekspresi protein Gag, Pol, Env, Vif, Vpu, dan Vpr.
3. Penting untuk infektivitas dan replikasi pada sel primer; berperan dalam tahap awal replikasi HIV
4. Mediasi replikasi di sel yang tidak membelah
5. Berfungsi seperti Vpr
6. Degradasi CD4; meningkatkan pelepasan HIV; pembentukan membran protein integral; regulasi ekpresi permukaan sel terhadap MHC I
7. Meningkatkan produksi HIV di tahap akhir; mengatur ekspresi MHC I dan CD4